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離心分離方法專題介紹
  • 發(fā)布日期:2018-06-27      瀏覽次數(shù):5017
    • 在實(shí)驗(yàn)過程中,由于樣品的各種性質(zhì)差異,只有選擇了正確的離心方法,才能獲得預(yù)期的分離純化結(jié)果。常用的離心方法主要有差速離心法、密度梯度離心法。其中密度梯度離心法又可細(xì)分為速率區(qū)帶離心和等密度梯度離心法。

       

      離心方法——差速離心  
           

      差速離心法 (differebtial velocity centrifugation method) 又稱離心力差分離法。原理是利用樣品中各組分沉降系數(shù)的差異,對(duì)不同的微粒施以不同的離心力,經(jīng)過多次離心,離心速度逐步加大,將不同的微粒依次沉降,從而實(shí)現(xiàn)離心分離。如果分離樣品中有大中小三種不同粒徑的微粒,對(duì)它們施以不同的離心力,大粒徑的微粒,其質(zhì)量較大,首先沉降。分離上清液,以更大轉(zhuǎn)速對(duì)上清液進(jìn)行第二次離心,中顆粒被分離出來。再取上清以更大離心力,更高的轉(zhuǎn)速,后沉降小顆粒,以達(dá)到不同顆粒的分離,如圖 1 所示。由于在每種顆粒的沉淀物中總含有部分次級(jí)顆粒,如想將某種顆粒提純,需對(duì)該顆粒的沉淀物進(jìn)行稀釋后再離心沉淀,終可制備出理想純度的顆粒。


      圖 1 差速離心
       

      由于小粒徑的微粒質(zhì)量小,分離時(shí)所需離心力大。為滿足大離心力的需要,必需提高其旋轉(zhuǎn)速度,方可分離。以不同的離心力分離不同粒徑的微粒是動(dòng)力學(xué)的分離方法。特別是沉降速度差別較大的微粒多采用此種分離方法。差速離心原理可用離心力表達(dá)式說明。F=ma 其中 a=ω²R

       

      差速離心主要用于分離直徑和密度差異較大的顆粒。差速離心法的優(yōu)點(diǎn)是分離時(shí)間短、重復(fù)性高,樣品處理量大,可用于大量樣品的初分離。其缺點(diǎn)是分離復(fù)雜樣品和要求分離純度較高時(shí),離心次數(shù)多,操作繁雜。由于沉淀的多次清洗、溶解、再沉淀,容易引起中間損失,所以離心分辨力差。實(shí)際分離時(shí)由于離心時(shí)的對(duì)流、擴(kuò)散和收取沉淀時(shí)的污染,對(duì)于一些沉降系數(shù)相差不大的組分無法進(jìn)行*的分離提純。樣品的純度和回收率都不理想,因此差速離心法主要用于大量樣品的初步分離提純。
       

      例如,我們可以對(duì)動(dòng)物肝組織勻漿液進(jìn)行多次的不同相對(duì)離心力和時(shí)間的離心和沉淀/上清分步收集,得到樣品的細(xì)胞核、線粒體、溶酶體和核糖體等的初步分離富集沉淀,用于下一步的其他檢測或者精細(xì)純化實(shí)驗(yàn)。具體的處理流程如下:


       

       

      離心方法——速率區(qū)帶離心法

       

      密度梯度離心(isodensity centrifugation method)又稱為區(qū)帶離心。離心時(shí)先將樣品溶液置于一個(gè)由惰性梯度材料形成的密度梯度液體柱中,離心后被分離組分以區(qū)帶層分布于梯度柱中。該方法的優(yōu)點(diǎn)是可以同時(shí)使樣品中幾種或全部組分分離,具有良好的分辨率,分離效果好,可一次獲得較純組分。缺點(diǎn)是離心時(shí)間較長,需制備梯度液,操作要求高。按照離心分離原理,密度梯度離心又可分為速率區(qū)帶離心法(rate zonal centrifugation method,R-Z)又稱連續(xù)密度梯度離心法和等密度離心法 (isopycnic centrifugation method) 又稱不連續(xù)密度梯度離心法。

       

       

      速率區(qū)帶離心也可稱為等區(qū)密度離心,是根據(jù)樣品中不同組分粒子所具有的不同的體積大小和不同的沉降系數(shù)將混合樣品進(jìn)行離心分離提純。離心時(shí)將需要分離的樣品溶液置于由密度梯度材料,如蔗糖、氯化銫 (CsCI)、溴化鈉等形成的梯度液柱上面,樣品粒子的密度必須大于梯度液柱中任一點(diǎn)的密度,否則得不到理想的區(qū)帶離心效果。離心時(shí),混合樣品中不同的組分將在梯度液柱的不同位置分別形成各自的區(qū)帶,選擇適合的轉(zhuǎn)速和時(shí)間進(jìn)行離心,當(dāng)各組分區(qū)帶距離拉得遠(yuǎn)時(shí),結(jié)束離心,然后將區(qū)帶取出。這樣只需通過一次離心就可以把混合樣品中的各組分分離提純,其純度和回收率均可滿足要求。優(yōu)點(diǎn)是一次分離純化,組分的沉降系數(shù)相差 20% 以上的即可選用此法,分辨力高,操作熟練可以將組分沉降系數(shù)相差 5%~10% 的樣品很好的分離。缺點(diǎn)是材料的條件限制,樣品液濃度不能太高,否則操作條件很難控制,同時(shí)此法與差速離心法相比,處理樣品的量要小的多。

       


      圖 2 速率區(qū)帶離心
       

      速率區(qū)帶離心的時(shí)間必須嚴(yán)格控制,不能太短,否則樣品區(qū)帶不清,時(shí)間也不能太長,否則待分離組分可能沉底。需要分離的樣品顆粒的沉降速度取決丁顆粒形狀、大小、密度及離心力等因素。離心前后樣品的狀態(tài)如圖 2 所示。
       

      速率區(qū)帶離心經(jīng)典的應(yīng)用就是通過蔗糖密度梯度離心,進(jìn)行各種亞細(xì)胞器(核糖體、線粒體、Exosome 等)和病毒顆粒(病毒載體、疫苗等)的純化。例如,我們在上一期中得到的 70S 核糖體沉淀,經(jīng)過水解后,可利用蔗糖密度梯度離心,進(jìn)一步分離純化得到 50S 和 30S 的兩個(gè)亞基。具體的實(shí)驗(yàn)流程如下:

       

       

      離心方法——等密度梯度離心法

       

      等密度梯度離心也稱為平衡密度梯度離心。等密度梯度離心是根據(jù)樣品中各組分的浮力密度差不同進(jìn)行分離。在離心立場中,溶液中顆粒浮力密度小則上浮,浮力密度大則下沉,上浮和下沉的顆粒會(huì)一直延梯度液移動(dòng)到與其浮力密度恰好相等的位置上,該位置也稱顆粒的等密度點(diǎn),離心時(shí)樣品各組分顆粒將按其密度大小分別移至等密度點(diǎn)形成區(qū)帶,形成的區(qū)帶不會(huì)因離心時(shí)間長而發(fā)生變化。離心后收集所需區(qū)帶顆粒即為純化組分。離心前后樣品的狀態(tài)如圖 5-3 所示。


                                                                   

      圖 3 等密度區(qū)帶離心
       

      因此,在離心前,樣品可置于梯度液的任意位置,一般是均勻分布在梯度液中。等密度區(qū)帶離心法的離心效果取決于樣品顆粒的浮力密度差,密度差越大,分離效果越顯著,與樣品顆粒的大小與現(xiàn)狀無關(guān)。
       

      速率區(qū)帶離心和等密度區(qū)帶離心都需預(yù)準(zhǔn)備梯度液。速率區(qū)帶離心的梯度液密度必須小于待分離組分中小顆粒的浮力密度。利用顆粒形狀和大小差異而形成的沉降速率不同達(dá)到分離目的。等密度區(qū)帶離心是一種平衡離心方法,利用顆粒密度差進(jìn)行分離,與顆粒形狀和大小無關(guān),處理量比差速離心法大。
       

      等密度梯度離心經(jīng)常使用的梯度液包括氯化銫 (CsCI)、溴化鈉等,典型的應(yīng)用包括質(zhì)粒 DNA(或者其他 DNA、RNA 核酸片段)的大規(guī)模高純度純化,脂蛋白的分離純化等。
       

      質(zhì)粒 DNA 的氯化銫等密度梯度離心分離純化流程如下:

       

       


      脂蛋白溴化鈉等密度梯度離心分離純化流程如下:
       

      1) 人全血 1000 g 離心 10 分鐘去除各種血細(xì)胞,上清為血清。

      2) 血清加入 NaBr 密度梯度液(不連續(xù)梯度)的底部,往上依次鋪濃度變小的梯度液。

      3) 然后在水平轉(zhuǎn)頭中,260,000 g 離心力 14℃ 下離心 24 小時(shí),各種密度的脂蛋白從管底浮向它們自己的等密度區(qū)形成了純的各種密度脂蛋白區(qū)。而離心管底部保留著各種血清蛋白。

      4) 用上排法從離心管中抽出格層液體,經(jīng) DU 核酸蛋白分析儀測定,定位各種不同密度血清脂蛋白。

       

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